Sự khác biệt chính giữa các đầu dò DNA và RNA là các đầu dò DNA là các đoạn DNA bổ sung cho các trình tự nucleotide đích trong khi các đầu dò RNA là các đoạn RNA sợi đơn là các chuỗi axit nucleic bổ sung của các trình tự đích.
Một mẫu dò là một chuỗi ngắn DNA hoặc RNA được tổng hợp nhân tạo có thể được đánh dấu phóng xạ hoặc với các phân tử không hoạt tính. Nó có thể có độ dài từ 100 đến 1000 cơ sở. Đầu dò rất hữu ích trong việc phát hiện trình tự nucleotide đích bổ sung cho trình tự của đầu dò. Sau khi được thêm vào, các đầu dò sẽ được lai với các trình tự bổ sung hoặc trình tự đích và làm cho nó có thể nhìn thấy để xác định các trình tự đích vì nó mang phóng xạ. Đầu dò là công cụ phân tử quan trọng trong nhiều lĩnh vực vi sinh vật và phân tử như phát hiện bệnh di truyền, virus học, bệnh lý pháp y, xét nghiệm quan hệ cha con, lấy dấu vân tay DNA, RFLP, di truyền tế bào phân tử, lai tại chỗ, v.v.
Đầu dò DNA là gì?
Đầu dò DNA là các đoạn DNA sợi đơn. Chúng có thể được sử dụng để phát hiện sự hiện diện của trình tự axit nucleic bổ sung (trình tự đích) bằng cách lai. Khi một mẫu dò DNA lai với trình tự bổ sung của nó, nó sẽ tạo thành một lai sợi kép. Để phát hiện chúng, các đầu dò DNA thường được đánh dấu bằng đồng vị phóng xạ, biotin, epitop hoặc fluorophores. Các đầu dò DNA được đánh dấu bằng biotin có thể được phát hiện bằng phosphatase kiềm được đánh dấu streptavidin bằng một số phương pháp hóa học và enzym.
Hình 01: Đầu dò DNA
Đã biết trình tự nucleotide của mẫu dò DNA. Chúng là những chuỗi ngắn với độ dài từ 100 đến 1000 cặp bazơ. Các mẫu dò DNA dài có thể được tạo ra bằng công nghệ DNA tái tổ hợp. Chúng cũng có thể được tạo ra bằng PCR và nhân bản. Trong các phòng thí nghiệm vi sinh lâm sàng, các đầu dò DNA luôn có sẵn để chẩn đoán nhanh các bệnh truyền nhiễm.
Đầu dò RNA là gì?
Đầu dò RNA là các đoạn RNA đơn sợi. Chúng là các trình tự bổ sung cho các trình tự đích trong mẫu. Chúng thường được tổng hợp với RNA polymerase từ các đại thực khuẩn SP6, T7 hoặc T3 bằng cách phiên mã trong ống nghiệm của DNA. Các đầu dò RNA dài có thể được tạo ra bằng cách phiên mã in vitro từ DNA plasmid tuyến tính. Nói chung, các đầu dò RNA liên kết mạnh mẽ và chặt chẽ hơn với các trình tự bổ sung của chúng so với các đầu dò DNA. Tương tự như các đầu dò DNA, các đầu dò RNA cũng có thể được đánh dấu trong khi chúng đang được phiên mã.
Điểm giống nhau giữa đầu dò DNA và RNA là gì?
- Cả hai đầu dò DNA và RNA đều là trình tự nucleotide mạch đơn.
- Cả hai đều được thiết kế và tổng hợp nhân tạo.
- Hơn nữa, chúng có thể được dán nhãn bằng đồng vị phóng xạ, epitop, biotin hoặc fluorophores.
- Chúng có ái lực mạnh mẽ với trình tự đích DNA hoặc RNA cụ thể.
- Chúng được sử dụng trong các kỹ thuật lai thấm và lai tại chỗ khác nhau để phát hiện các trình tự axit nucleic đích.
- Cả hai loại đầu dò đều có thể được lai với trình tự bổ sung của chúng.
- Chúng cũng được sử dụng để xác định vi sinh vật và chẩn đoán các bệnh truyền nhiễm, di truyền và các bệnh khác.
Sự khác biệt giữa đầu dò DNA và RNA là gì?
Đầu dò DNA là một đoạn DNA ngắn bổ sung cho trình tự đích. Mặt khác, đầu dò RNA là một đoạn RNA ngắn sợi đơn bổ sung cho trình tự đích. Do đó, đây là điểm khác biệt chính giữa các đầu dò DNA và RNA. Hơn nữa, các đầu dò DNA chứa A, T, C và G trong khi các đầu dò RNA chứa A, U, C và G.
Hơn nữa, một điểm khác biệt nữa giữa các đầu dò DNA và RNA là tính ổn định nhiệt động lực học của chúng. Đầu dò RNA cho thấy độ ổn định nhiệt động học cao hơn so với đầu dò DNA.
Bảng đồ họa thông tin dưới đây trình bày những điểm khác biệt quan trọng giữa các đầu dò DNA và RNA.
Tóm tắt - Đầu dò DNA và RNA
Một mẫu dò là một đoạn DNA hoặc RNA nhỏ được sử dụng để phát hiện sự hiện diện của một trình tự cụ thể trong mẫu DNA hoặc RNA bằng cách lai phân tử. Các đầu dò DNA là các đoạn DNA sợi đơn ngắn trong khi các đầu dò RNA là các trình tự RNA sợi đơn ngắn. Chúng là những trình tự đã biết. Độ ổn định nhiệt động học ở đầu dò RNA cao hơn đầu dò DNA. Các đầu dò RNA liên kết chặt chẽ với các trình tự bổ sung của chúng hơn là liên kết với các đầu dò DNA. Do đó, điều này tóm tắt sự khác biệt giữa các đầu dò DNA và RNA.
