Sự khác biệt chính giữa LINE và SINE là LINE (các nguyên tố hạt nhân dài xen kẽ) là một loại chuyển hóa lại không LTR dài hơn trong khi SINE (các nguyên tố hạt nhân xen kẽ ngắn) là một loại chuyển hóa lại không LTR ngắn hơn nhiều.
Bản truyền lại không phải LTR không chứa các lần lặp lại đầu cuối dài (LTR). Tuy nhiên, chúng chứa các gen cho enzym phiên mã ngược, protein liên kết ARN, nuclease, và vùng ribonuclease H. Các retrotransposon không phải LTR có thời gian lặp lại ngắn. Những lần lặp lại này có thứ tự đảo ngược của các cơ sở bên cạnh nhau. Ngoài ra, các dịch chuyển lại không phải LTR cũng có các đoạn lặp lại trực tiếp được tìm thấy trong các chuyển vị LRT. Các bản truyền lại không phải LTR được chia thành hai loại là LINE và SINE.
DÒNG là gì?
DÒNG (các nguyên tố hạt nhân dài xen kẽ) là các hạt truyền lại không LTR dài hơn. Chúng phổ biến rộng rãi trong bộ gen của sinh vật nhân chuẩn. Chúng thường chiếm 21,1% bộ gen người. Mỗi LINE dài khoảng 7000 cặp cơ sở. LINE có thể phiên mã thành mRNA và dịch thành một protein có thể hoạt động như một enzyme phiên mã ngược. Enzyme phiên mã ngược này tạo ra các bản sao DNA của RNA LINE. Những bản sao DNA này có thể được tích hợp vào bộ gen tại một địa điểm mới.
Hình 01: LINEs và SINEs
Bộ gen của con người chỉ có một DÒNG dồi dào được gọi là LINE-1. Phần tử LINE-1 dài khoảng 6000 cặp cơ sở. Có khoảng 100.000 phần tử LINE-1 bị cắt ngắn trong bộ gen người. Đột biến ngẫu nhiên có thể xảy ra trong LINE. Do đột biến ngẫu nhiên, các DÒNG có thể bị thoái hóa. Chúng không còn được phiên âm hoặc dịch. Hơn nữa, các LINE được nhóm thành năm nhóm chính như L1, RTE, R2, I và jockey. Năm nhóm này lại chia nhỏ thành 28 nhóm khác.
DÒNG thường được lan truyền thông qua một cơ chế được gọi là cơ chế phiên mã ngược có mồi đích (TPRT). Chèn LINEs gây ra các bệnh ở người như bệnh máu khó đông A, ung thư, rối loạn mendel, v.v … Hypomethyl hóa LINEs cũng gây ra một số loại ung thư.
SINEs là gì?
SINE (các nguyên tố hạt nhân xen kẽ ngắn) là một loại chuyển hóa lại không LTR ngắn hơn nhiều. Chúng có chiều dài khoảng 100 đến 700 cặp cơ sở. SINE cũng là các phần tử DNA tự khuếch đại trong bộ gen của sinh vật nhân chuẩn thông qua chất trung gian RNA. SINEs chiếm khoảng 13% bộ gen của động vật có vú. Các vùng bên trong của SINE bắt nguồn từ tRNA. Nó vẫn được bảo tồn rất cao. Chúng thường có mặt ở nhiều loài động vật có xương sống và không xương sống. Sự biến đổi số lượng bản sao và các đột biến trong SINE có thể được kết hợp để xây dựng phân loại dựa trên phát sinh loài của các loài.
SINEs có thể được nhóm thành ba loại chính: CORE-SINEs, V-SINEs và AmnSINEs. Nguyên tố Alu là SINE phổ biến nhất ở các loài linh trưởng. Hơn nữa, có hơn 50 căn bệnh ở người có liên quan đến việc chèn các SINE. Khi chúng chèn vào bên trong hoặc gần exon, chúng có thể gây ra mối nối không chính xác hoặc thay đổi khung đọc. Điều này dẫn đến các kiểu bệnh như ung thư vú, ung thư ruột kết, bệnh bạch cầu, bệnh máu khó đông, bệnh xơ nang, ung thư ruột kết, bệnh Dent, bệnh u sợi thần kinh, v.v.
Điểm giống nhau giữa LINE và SINE là gì?
- LINEs và SINE là hai loại dịch chuyển lại không phải LTR.
- Cả hai đều không có vùng đầu cuối dài (LTR).
- Cả hai chủ yếu chỉ được tìm thấy ở sinh vật nhân chuẩn.
- Cả hai đều không tự chủ.
Sự khác biệt giữa LINE và SINE là gì?
LINEs là các trình truyền lại không phải LTR dài hơn, trong khi SINEs là các trình truyền lại không phải LTR ngắn hơn nhiều. Vì vậy, đây là sự khác biệt chính giữa LINE và SINE. Hơn nữa, LINES mã cho enzym phiên mã ngược, trong khi SINE không mã cho enzym phiên mã ngược. Do đó, đây là một điểm khác biệt giữa LINE và SINE.
Sự khác biệt khác giữa LINE và SINE được liệt kê bên dưới dưới dạng bảng để so sánh song song.
Tóm tắt - LINEs vs SINEs
Retrotransposons chủ yếu được tìm thấy ở tất cả các sinh vật nhân thực nhưng không có ở sinh vật nhân sơ. Khoảng 37% bộ gen người chứa retrotransposon. Retrotransposons chủ yếu có hai loại: LTR và Non-LTR retrotransposons. Các bản dịch lại không phải LTR không chứa các đoạn lặp lại đầu cuối dài (LTR), có trong các bản dịch lại LTR. Các retrotransposons không phải LTR được chia thành hai loại: LINE và SINE. LINEs dài hơn không phải là LTR truyền lại, trong khi SINE là ngắn hơn nhiều không phải LTR truyền lại. Vì vậy, đây là tóm tắt về sự khác biệt giữa LINE và SINE.
