Sự khác biệt chính - Nhiễm sắc thể Đi bộ và Nhảy
Di chuyển nhiễm sắc thể và nhảy nhiễm sắc thể là hai công cụ kỹ thuật được sử dụng trong sinh học phân tử để xác định vị trí các gen trên nhiễm sắc thể và lập bản đồ vật lý của bộ gen. Di chuyển nhiễm sắc thể là một kỹ thuật được sử dụng để nhân bản gen mục tiêu trong thư viện bộ gen bằng cách phân lập lặp đi lặp lại và nhân bản các dòng vô tính lân cận của thư viện bộ gen. Nhảy nhiễm sắc thể là một phiên bản đặc biệt của bước đi nhiễm sắc thể, nó vượt qua các điểm đứt gãy của bước đi nhiễm sắc thể. Di chuyển nhiễm sắc thể chỉ có thể trình tự và lập bản đồ các chiều dài nhỏ của nhiễm sắc thể trong khi nhảy nhiễm sắc thể cho phép giải trình tự các phần lớn của nhiễm sắc thể. Đây là điểm khác biệt chính giữa đi bộ nhiễm sắc thể và nhảy nhiễm sắc thể.
Đi bộ nhiễm sắc thể là gì?
Đi bộ nhiễm sắc thể là một công cụ khám phá các vùng trình tự chưa biết của nhiễm sắc thể bằng cách sử dụng các đoạn giới hạn chồng chéo lên nhau. Trong bước đi của nhiễm sắc thể, một phần của gen đã biết được sử dụng như một mẫu dò và tiếp tục với việc xác định chiều dài đầy đủ của nhiễm sắc thể cần lập bản đồ hoặc sắp xếp trình tự. Điều này đi từ điểm đánh dấu đến độ dài mục tiêu. Trong bước đi của nhiễm sắc thể, các đầu của mỗi đoạn chồng chéo được sử dụng để lai ghép nhằm xác định trình tự tiếp theo.
Các đầu dò được chuẩn bị từ các đoạn cuối của DNA nhân bản và chúng được nhân dòng lại. Sau đó, chúng được sử dụng để tìm đoạn chồng chéo tiếp theo. Tất cả các trình tự chồng chéo này được sử dụng để xây dựng bản đồ di truyền của nhiễm sắc thể và xác định vị trí các gen mục tiêu. Đây là một phương pháp phân tích các đoạn DNA dài bằng các đoạn nhỏ chồng lên nhau từ thư viện hệ gen được tái cấu trúc.
Kỹ thuật đi bộ nhiễm sắc thể - Các bước
-
Phân lập một đoạn DNA có chứa gen hoặc điểm đánh dấu đã biết gần gen đích
- Chuẩn bị bản đồ giới hạn của đoạn đã chọn và ép xung vùng cuối của đoạn để sử dụng làm đầu dò
- Kết hợp đầu dò với mảnh chồng chéo tiếp theo
- Chuẩn bị bản đồ giới hạn của phân đoạn 1 và ép xung con vùng cuối của phân mảnh 1 để sử dụng như một thăm dò để xác định phân đoạn chồng chéo tiếp theo.
- Kết hợp đầu dò với mảnh chồng chéo tiếp theo 2
- Chuẩn bị bản đồ giới hạn của phân đoạn 2 và ép xung con vùng cuối của phân mảnh 2 để phục vụ như một thăm dò để xác định phân đoạn chồng chéo tiếp theo
Các bước trên phải được tiếp tục cho đến khi gen mục tiêu hoặc tối đa 3 'cuối tổng chiều dài của trình tự.
Hình 01: Kỹ thuật đi bộ nhiễm sắc thể
Di chuyển nhiễm sắc thể là một khía cạnh quan trọng của di truyền tế bào trong việc tìm kiếm SNP của nhiều sinh vật và phân tích các bệnh di truyền và tìm ra các đột biến của các gen có liên quan.
Nhảy nhiễm sắc thể là gì?
Nhảy nhiễm sắc thể là một kỹ thuật được sử dụng trong sinh học phân tử để lập bản đồ vật lý về bộ gen của sinh vật. Kỹ thuật này được giới thiệu để vượt qua rào cản di chuyển của nhiễm sắc thể nảy sinh khi tìm thấy các vùng DNA lặp lại trong quá trình nhân bản. Vì vậy, kỹ thuật nhảy nhiễm sắc thể có thể coi là một phiên bản đặc biệt của kỹ thuật đi bộ nhiễm sắc thể. Đây là một phương pháp nhanh chóng so với đi bộ nhiễm sắc thể và cho phép bỏ qua các trình tự DNA lặp đi lặp lại mà không dễ bị nhân bản trong quá trình di chuyển nhiễm sắc thể. Nhảy nhiễm sắc thể thu hẹp khoảng cách giữa gen mục tiêu và các điểm đánh dấu đã biết sẵn có để lập bản đồ bộ gen.
Công cụ nhảy nhiễm sắc thể bắt đầu bằng việc cắt một DNA cụ thể với các endonuclease giới hạn đặc biệt và thắt các đoạn thành các vòng tuần hoàn. Sau đó, một đoạn mồi được thiết kế từ một trình tự đã biết được sử dụng để sắp xếp các vòng tuần hoàn. Lớp mồi này cho phép nhảy và sắp xếp trình tự theo một cách khác. Do đó, nó có thể bỏ qua các trình tự DNA lặp lại và nhanh chóng đi qua nhiễm sắc thể để tìm kiếm gen đích.
Việc phát hiện ra gen mã hóa bệnh xơ nang được thực hiện bằng công cụ nhảy nhiễm sắc thể. Kết hợp với nhau, nhảy và đi bộ nhiễm sắc thể có thể nâng cao quá trình lập bản đồ bộ gen.
Hình 02: Nhảy nhiễm sắc thể
Sự khác biệt giữa Đi bộ và Nhảy của Nhiễm sắc thể là gì?
Nhiễm sắc thể Đi bộ vs Nhảy |
|
| Nhiễm sắc thể là một công cụ được sử dụng trong sinh học phân tử để lập bản đồ bộ gen và định vị các gen cụ thể. | Nhảy nhiễm sắc thể là một công cụ được sử dụng để lập bản đồ vật lý các bộ gen và tìm nhanh các gen đích trong nhiễm sắc thể. |
| Độ dài So sánh của Trình tự | |
| Chỉ những mảnh nhỏ có thể được nhân bản bằng cách di chuyển nhiễm sắc thể. | Độ dài lớn hơn của nhiễm sắc thể có thể được lập bản đồ bằng cách nhảy nhiễm sắc thể. |
| Nhân bản DNA lặp lại trong nhiễm sắc thể | |
| Kỹ thuật đi bộ nhiễm sắc thể gặp khó khăn trong việc đi qua các chuỗi DNA lặp lại được tìm thấy trong nhiễm sắc thể. | Nó cho phép bỏ qua các trình tự DNA lặp đi lặp lại. Do đó, không có khó khăn gì khi tìm thấy chúng trong quá trình giải trình tự. |
| Các yếu tố ảnh hưởng đến quá trình | |
| Sự thành công của quá trình phụ thuộc vào kích thước của bộ gen và khoảng cách phải được “đi bộ” từ một vị trí bộ gen đã biết đến gen mong muốn. | Sự thành công không phụ thuộc vào kích thước bộ gen của khoảng cách từ điểm đánh dấu đến mục tiêu. |
| Ảnh hưởng của DNA chưa mở | |
| Sự di chuyển của nhiễm sắc thể có thể bị dừng lại bởi các đoạn DNA chưa được mở. | Piccolos nốt thấp nhất có thể chơi là D4. |
| Cần Trình tự Đã biết | |
| Quá trình bắt đầu với một gen đã biết gần mục tiêu. | Quá trình này yêu cầu một đoạn đã biết để thiết kế lớp sơn lót. |
Tóm tắt - Nhiễm sắc thể Đi bộ vs Nhảy
Di chuyển nhiễm sắc thể thường được áp dụng khi biết rằng một gen cụ thể nằm gần gen đã được nhân bản trước đó trong nhiễm sắc thể và có thể xác định nó bằng cách phân lập lặp đi lặp lại các dòng gen lân cận từ thư viện bộ gen. Tuy nhiên, khi các vùng DNA lặp lại được tìm thấy trong kỹ thuật di chuyển nhiễm sắc thể, quá trình này sẽ không thể tiếp tục. Do đó, kỹ thuật bị phá vỡ từ thời điểm đó. Nhảy nhiễm sắc thể là một công cụ sinh học phân tử khắc phục hạn chế này để lập bản đồ hệ gen. Nó bỏ qua những vùng DNA lặp đi lặp lại khó sao chép này và giúp lập bản đồ vật lý của bộ gen. Đây là sự khác biệt chính giữa đi bộ và nhảy của nhiễm sắc thể.
