Sự khác biệt cơ bản giữa kết hợp phân tử và tính điểm là docking là một kỹ thuật được sử dụng để xác định ái lực liên kết giữa hai phân tử trong khi tính điểm là một quá trình đánh giá một tư thế cụ thể bằng cách đếm số lượng các tương tác giữa các phân tử thuận lợi.
Các thuật ngữ ghép và cho điểm phân tử được sử dụng trong lĩnh vực mô hình phân tử. Mô hình phân tử là một kỹ thuật được sử dụng để xác định sự sắp xếp có thể có của các phân tử khác nhau trong một chất nhất định. Kỹ thuật này rất quan trọng trong việc tạo ra các hợp chất ổn định mới.
Molecular Docking là gì?
Ghép nối phân tử là một mô phỏng tính toán của một phối tử ứng cử viên liên kết với một thụ thể. Phương pháp này dự đoán hướng ưu tiên của một phân tử này sang phân tử khác khi liên kết với nhau để tạo thành một phức chất bền. Kết quả thu được từ kỹ thuật này có thể được sử dụng để dự đoán độ bền của liên kết hoặc ái lực liên kết giữa hai phân tử. Ở đây, chức năng cho điểm phân tử cũng rất quan trọng.
Hình 01: Sơ đồ Đơn giản cho thấy Quá trình Tương tác Phân tử trong Hệ thống Sinh học
Nói chung, kỹ thuật này xem xét các phân tử có liên quan về mặt sinh học như protein, peptit, axit nucleic, carbohydrate và lipid. Những phân tử này rất quan trọng, và chúng đóng một vai trò quan trọng trong cơ chế truyền tín hiệu trong cơ thể chúng ta. Do đó, định hướng của hai phân tử sẽ liên kết cho quá trình truyền tín hiệu này ảnh hưởng đến loại tín hiệu được tạo ra ở đây. Điều đó có nghĩa là; kết nối phân tử rất quan trọng trong việc xác định cả cường độ và loại tín hiệu được tạo ra trong quá trình truyền tín hiệu trong các hệ thống sinh học.
Hơn nữa, kỹ thuật ghép nối phân tử rất quan trọng trong việc thiết kế các loại thuốc dựa trên cấu trúc. Đó là do khả năng dự đoán của nó về cấu trúc liên kết của các phân tử nhỏ như phối tử với một vị trí liên kết thích hợp.
Chấm điểm Phân tử là gì?
Tính điểm phân tử là một loại hàm toán học hữu ích trong việc đánh giá tiến trình của quá trình ghép nối phân tử. Trong lĩnh vực hóa học tính toán, các hàm cho điểm được sử dụng để dự đoán ái lực liên kết giữa hai phân tử sau quá trình gắn kết. Ví dụ, nếu chúng ta có một phân tử nhỏ của thuốc dạng hạt và có mục tiêu sinh học như protein, chúng ta có thể đánh giá ái lực của thuốc đối với vị trí liên kết. Hơn nữa, điểm phân tử có thể được sử dụng để dự đoán tương tác giữa các phân tử giữa hai protein hoặc giữa một protein và các phân tử DNA.
Hình 02: Chức năng Chấm điểm trong Tóm tắt
Ứng dụng chính của tính điểm phân tử là trong quy trình thiết kế thuốc - ví dụ, sàng lọc ảo, thiết kế de novo, tối ưu hóa chì, v.v.
Sự khác biệt giữa Gắn kết phân tử và Ghi điểm là gì?
Gắn kết phân tử và cho điểm rất quan trọng trong mô hình phân tử. Sự khác biệt cơ bản giữa gắn kết phân tử và tính điểm là docking là một kỹ thuật được sử dụng để xác định ái lực liên kết giữa hai phân tử trong khi tính điểm là một quá trình đánh giá một tư thế cụ thể bằng cách đếm số lượng các tương tác thuận lợi giữa các phân tử.
Đồ họa thông tin sau đây tóm tắt sự khác biệt giữa kết nối phân tử và tính điểm.
Tóm tắt - Gắn kết phân tử vs Ghi điểm
Gắn kết phân tử và cho điểm rất quan trọng trong mô hình phân tử. Sự khác biệt cơ bản giữa gắn kết phân tử và tính điểm là docking là một kỹ thuật được sử dụng để xác định ái lực liên kết giữa hai phân tử trong khi tính điểm là một quá trình đánh giá một tư thế cụ thể bằng cách đếm số lượng các tương tác thuận lợi giữa các phân tử.
