Sự khác biệt chính giữa cis và trans splicing là cis splicing là một cơ chế nội phân tử loại bỏ các intron và tham gia các exon nằm trong cùng một bản sao RNA, trong khi trans-splicing là một cơ chế liên phân tử loại bỏ các intron hoặc outron và tham gia vào các exon không nằm trong cùng một phiên mã RNA.
RNA nối là một hình thức xử lý RNA trước khi tổng hợp protein. Trong quá trình này, một bản phiên mã RNA tiền thông tin mới được tạo ra sẽ được biến đổi thành một RNA thông tin trưởng thành. RNA thông tin trưởng thành giúp tạo ra một phân tử protein. Trong quá trình nối RNA, các intron (vùng không mã hóa) bị loại bỏ, và các exon (vùng mã hóa) được nối với nhau để tạo nên mRNA trưởng thành. Cis và trans splicing là hai loại cơ chế nối RNA.
Cis Splicing là gì?
Cis splicing là một cơ chế nội phân tử loại bỏ các intron và nối các exon nằm trong cùng một phiên mã RNA. Quá trình nối cis bình thường tạo ra một phân tử RNA. Nối cis là quá trình nối điển hình của pre mRNA được thực hiện bởi các splicesome. Trong intron, một vị trí cho (5’cuối của intron), một nhánh (gần 3’ cuối intron) và một nơi nhận (3’cuối intron) rất cần thiết cho việc nối. Vị trí của nhà tài trợ mối nối bao gồm một trình tự bất biến GU ở đầu 5’của intron. Vị trí nhận mối nối ở đầu 3’của intron có trình tự AG bất biến. Ngược dòng từ trình tự AG, có một vùng được gọi là vùng pyrimidine (đường polypyrimidine). Xa hơn ngược dòng từ đường polypyrimidine, có một điểm nhánh bao gồm một nucleotide adenosine. Nuclêôtit này tham gia vào quá trình hình thành lariat.
Hình 01: Cis và Trans Splicing
Các liên kết chính là U1, U2, U4, U5 và U6. Trong số đó, U1 và U2 rất quan trọng. Trong cách nối cis, U1 liên kết với vị trí mối nối 5 'và U2 liên kết với điểm nhánh gần vị trí mối nối 3'. U5 / U4 / U6 liên kết với các exon tại vị trí 5’, với U6 liên kết với U2. Sau đó, U1 được phát hành. U5 chuyển từ exon sang intron và U6 liên kết tại vị trí mối nối 5’. Hơn nữa, U4 cũng được phát hành. U6 / U2 xúc tác phản ứng transesteri, làm cho đầu 5’của intron liên kết với nucleotit A trên intron. Điều này kích hoạt sự hình thành lariat. Trong quá trình hình thành lariat, U5 liên kết với exon tại vị trí mối nối 3 ', và vị trí 5' bị phân cắt. Ở giai đoạn cuối cùng của quá trình nối, U2 / U5 / U6 vẫn liên kết với lariat, và vị trí 3’bị phân cắt. Ngoài ra, các exon được phân giải bằng cách sử dụng quá trình thủy phân ATP trong giai đoạn này.
Trans Splicing là gì?
Ghép nối trans là một cơ chế liên phân tử loại bỏ các intron hoặc outron và tham gia vào các exon không nằm trong cùng một phiên mã RNA. Trong quá trình trans-splicing, không có vị trí nối 5’trên phân tử tiền mRNA để protein U1 liên kết. Thay vào đó, RNA dẫn đầu mối nối có giới hạn (SL) được phiên mã để trình tự trong outron.
Hình 02: Ghép nối
Outron là một vùng của pre mRNA giữa nắp 5’và vị trí trans splice. Tuy nhiên, protein U2 thường liên kết với vị trí mối nối 3’. Sau khi loại bỏ outron, exon thủ lĩnh mối nối (SL) được nối với exon đầu tiên trên pre mRNA. Hơn nữa, chuyển đoạn nối là một cơ chế được quan sát thấy ở một số vi sinh vật như sinh vật nguyên sinh thuộc lớp Kinetoplastae để biểu hiện gen.
Điểm giống nhau giữa Cis và Trans Splicing là gì?
- Cis và trans splicing là hai loại cơ chế nối RNA.
- Trong cả hai cơ chế, phần giới thiệu đều bị loại bỏ.
- Ngoài ra, trong cả hai cơ chế, các exon được kết hợp để tạo thành mRNA trưởng thành.
- Cả hai cơ chế đều được tìm thấy ở sinh vật nhân chuẩn.
- Những cơ chế này không có ở sinh vật nhân sơ.
Sự khác biệt giữa Cis và Trans Splicing là gì?
Cis splicing là một cơ chế nội phân tử loại bỏ các intron và tham gia các exon nằm trong cùng một phiên mã RNA, trong khi trans-splicing là một cơ chế liên phân tử loại bỏ các intron hoặc outron và tham gia các exon không nằm trong cùng RNA bảng điểm. Vì vậy, đây là sự khác biệt chính giữa cis và trans splicing. Hơn nữa, trong quá trình nối cis, các intron bị loại bỏ để tạo thành mRNA trưởng thành. Mặt khác, trong các intron hoặc outron nối trans sẽ bị loại bỏ để tạo thành mRNA trưởng thành.
Infographic sau liệt kê sự khác biệt giữa nối cis và trans ở dạng bảng để so sánh song song.
Tóm tắt - Cis vs Trans Splicing
RNA nối là một hình thức xử lý RNA trước quá trình tổng hợp protein. Cis và trans splicing là hai loại cơ chế nối RNA được tìm thấy ở sinh vật nhân thực. Nối cis là một cơ chế nội phân tử loại bỏ các intron và tham gia các exon nằm trong cùng một phiên mã RNA, trong khi phiên mã là một cơ chế liên phân tử loại bỏ các intron hoặc outron và tham gia các exon không nằm trong cùng một phiên mã RNA. Vì vậy, điều này kết thúc cuộc thảo luận về sự khác biệt giữa cis và trans splicing.
