Sự khác biệt chính - Gel xếp và Gel tách
Thuật ngữ gel xếp và gel tách được sử dụng để giải thích kỹ thuật SDS-PAGE. SDS-PAGE hoặc điện di trên gel natri dodecyl sulfat-polyacrylamide là một kỹ thuật trong phòng thí nghiệm được sử dụng để tách các phân tử protein dựa trên trọng lượng phân tử của chúng. Lý thuyết đằng sau kỹ thuật này là các protein có trọng lượng phân tử khác nhau cho thấy tốc độ di chuyển khác nhau; các phân tử trọng lượng phân tử thấp di chuyển nhanh hơn trong khi các phân tử trọng lượng phân tử cao di chuyển chậm. Môi trường để di chuyển là gel. Có hai loại gel được đặt tên là gel xếp và gel tách. Sự khác biệt chính giữa gel xếp và gel tách là độ pH của gel xếp chồng là 6,8 trong khi độ pH của gel tách là 8,8.
Gel xếp chồng là gì?
Stacking gel là một loại gel polyacrylamide có nồng độ thấp được đặt trên cùng của gel phân giải đậm đặc hơn (gel phân tách) trong kỹ thuật SDS-PAGE. Gel xếp chồng được sử dụng để cải thiện độ phân giải của điện di. Độ phân giải tăng lên do sự khác biệt giữa nồng độ của gel xếp và gel phân giải ảnh hưởng đến các protein trong mẫu. Vì nồng độ polyacrylamide trong gel xếp chồng thấp nên kích thước lỗ chân lông cao hơn. Điều này cũng giúp tăng sự phân tách.
Gel xếp chồng là gel polyacrylamide lỏng, có lỗ chân lông to chứa khoảng 7% polyacrylamide. Những lỗ chân lông này không hoạt động như một rào cản đáng kể đối với các phân tử protein lớn. Do đó, gel này ảnh hưởng một chút đến tính di động của các protein đó. Điều này giúp phân tách theo độ linh động và kích thước của protein bằng cách tập trung chúng vào giữa hai gel.
Hình 01: SDS-PAGE Acrylamide Gel
Độ pH của gel xếp chồng là 6,8. Độ pH của nó có tính axit hơn độ pH của gel phân giải 2 đơn vị pH. Độ pH này ngụ ý cường độ ion thấp hơn, do đó điện trở cao hơn. Điều này kích thích tính linh động của protein hơn các hạt tích điện khác có trong gel.
Gel Tách là gì?
Gel tách hoặc gel phân giải của SDS-PAGEtechnique là một loại gel polyacrylamide đậm đặc, được đặt ở trên cùng của gel xếp chồng đậm đặc thấp. Gel tách có chứa một lượng cao polyacrylamide (10%). Độ pH của gel này được duy trì là pH=8,8, đây là mức độ pH cao hơn so với độ pH của gel xếp chồng.
Hình 02: Thiết bị Điện di Gel
Khi các phân tử protein đến gel phân tách, sự di chuyển của các phân tử đó bị chậm lại vì gel phân tách là gel có nồng độ cao với kích thước lỗ nhỏ có thể hoạt động như một rào cản đáng kể cho sự di chuyển của các phân tử protein. Sự chậm lại này cho phép các protein khác di chuyển chậm để bắt kịp, dẫn đến một dải hẹp, cô đặc ở giữa hai gel.
Mối quan hệ giữa Gel xếp và Gel tách là gì?
Cả hai loại Gel xếp chồng và Gel tách đều được sử dụng trong cùng một bộ máy
Sự khác biệt giữa Gel xếp và Gel tách là gì?
Gel xếp chồng và Gel tách |
|
| Gel xếp chồng là một loại gel polyacrylamide có nồng độ thấp được đặt ở trên cùng của gel phân giải đậm đặc hơn (gel tách) trong kỹ thuật SDS-PAGE. | Gel tách hoặc gel phân giải của kỹ thuật SDS-PAGE là một loại gel polyacrylamide đậm đặc được đặt lên trên lớp gel xếp chồng đậm đặc thấp. |
| Vị trí | |
| Gel xếp chồng được đặt trên gel phân giải (tách). | Gel táchđược đặt dưới đáy hộp dùng để điện di gel. |
| Nồng độ | |
| Nồng độ gel xếp chồng cao. | Nồng độ gel tách thấp. |
| Nội dung polyacrylamide | |
| Gel xếp chồng chứa khoảng 7% polyacrylamide. | Gel tách chứa khoảng 10% polyacrylamide. |
| pH | |
| Độ pH của gel xếp chồng là 6,8. | Độ pH của gel tách là 8,8. |
| Kích thước lỗ chân lông | |
| Kích thước lỗ chân lông lớn có trong gel xếp. | Kích thước lỗ chân lông nhỏ có trong gel tách. |
| Độ phân giải | |
| Gel xếp chồng cho độ phân giải tốt hơn. | Gel tách có độ phân giải kém. |
Tóm tắt - Gel xếp và Gel tách
Gel xếp chồng và gel tách là hai loại gel polyacrylamide được sử dụng để phân tách tốt hơn các phân tử protein trong một mẫu nhất định. Sự khác biệt giữa gel xếp và gel tách là độ pH của gel xếp chồng là 6,8 trong khi độ pH của gel tách là 8,8.
