Sự khác biệt chính giữa PCR đồng thuận và PCR chảo là PCR đồng thuận luôn nhắm mục tiêu vào các vùng được bảo tồn trong khi PCR Pan nhắm vào các vùng biến đổi để xác định các chủng khác nhau của một nhóm
Polymerase chain reaction (PCR) là một kỹ thuật khuếch đại gen bao gồm ba bước chính là biến tính, ủ và mở rộng. Điều này được sử dụng rộng rãi trong chẩn đoán và xác định phân tử. Các kỹ thuật PCR đồng thuận và PCR Pan dựa trên các mục tiêu mồi mà mỗi loại PCR sử dụng.
PCR Đồng thuận là gì?
Đồng thuận PCR là một kỹ thuật PCR nhằm vào một khu vực được bảo tồn cho một loài hoặc chi cụ thể. Do đó, các vùng được bảo tồn cao được chọn để khuếch đại. Thông qua phương pháp này, các sinh vật có thể được xác định và phân biệt dựa trên sự đồng thuận của chúng. Phương pháp này xác định một khu vực được bảo tồn cho một loài cụ thể. Ví dụ, vùng rRNA 16 của vi khuẩn vẫn là vùng được bảo tồn giữa các vi khuẩn. Do đó, chỉ cần một bộ mồi cho quá trình khuếch đại. Trong hầu hết các trường hợp, một loại sơn lót phổ quát cụ thể có thể được sử dụng cho khu vực được bảo tồn.
Hình 01: Kỹ thuật PCR
Bằng cách tuân theo phương pháp PCR đồng thuận, có thể suy ra đặc điểm loài và các mối quan hệ tiến hóa. Dựa trên hiệu suất khuếch đại của sinh vật mẫu cụ thể, cũng có thể suy ra sự đồng thuận của sinh vật đối với nhóm. Hơn nữa, tiến hành PCR đồng thuận là rất quan trọng trong các nghiên cứu phát sinh loài. Nó cho phép xác định một loài và giải thích sự sai lệch mà sinh vật cụ thể thể hiện về tổ tiên chung.
Pan PCR là gì?
A Pan PCR là một chế độ ghép kênh của PCR. Trong kỹ thuật này, các chủng khác nhau được khuếch đại bằng cách sử dụng các mục tiêu mồi khác nhau. Tuy nhiên, các mục tiêu có thể là mục tiêu chung cho các nhóm chủng. Do đó, trong Pan PCR, có thể sử dụng nhiều hơn hai bộ mồi cùng một lúc. Nó có thể diễn ra theo phương pháp phản ứng đơn ống hoặc phương pháp phản ứng nhiều ống. Pan PCR tốn nhiều thời gian hơn và phức tạp hơn so với PCR đồng thuận. Vì lý do này, việc giải thích kết quả PCR cũng có thể phức tạp hơn trong Pan PCR.
Ứng dụng chính của Pan PCR là trong chẩn đoán phân tử. Nó cho phép phân biệt giữa các chủng khác nhau của một loài bằng cách khuếch đại mục tiêu. Pan PCR là một kỹ thuật lý tưởng để xác định các chủng khác nhau của một loài gây bệnh. Trong hầu hết các trường hợp, việc tự động hóa các kỹ thuật Pan PCR đối với các tình trạng sức khỏe khác nhau là rất quan trọng và là một kỹ thuật đáng tin cậy và hiệu quả cao.
Điểm giống nhau giữa PCR đồng thuận và PCR Pan là gì?
- Consensus PCR và Pan PCR là hai loại kỹ thuật PCR.
- Cả hai quy trình đều tuân theo quy trình ba bước chung - biến tính, ủ và gia hạn.
- Họ sử dụng mồi dành riêng cho mục tiêu.
- Cả hai phản ứng đều diễn ra trong máy tuần hoàn nhiệt.
- Những phản ứng này có thể được tự động hóa.
- Cả hai đều có thể được sử dụng trong chẩn đoán và xác định phân tử; tuy nhiên, độ chính xác khác nhau.
- Các thủ tục này yêu cầu xác nhận.
Sự khác biệt giữa PCR đồng thuận và PCR Pan là gì?
Cả Consensus và Pan PCR đều tuân theo cùng một quy trình thường quy. Tuy nhiên, sự khác biệt chính giữa PCR đồng thuận và PCR Pan là dựa trên các mục tiêu mồi mà mỗi quy trình sử dụng. Trong khi PCR đồng thuận luôn nhắm vào các vùng được bảo tồn, thì Pan PCR nhắm vào các vùng biến đổi để xác định các chủng khác nhau của một nhóm. Do sự khác biệt này, các giao thức thiết kế lớp sơn lót, số lượng bộ sơn lót được sử dụng và các ứng dụng cụ thể khác nhau.
Infographic dưới đây tóm tắt sự khác biệt giữa PCR đồng thuận và PCR Pan.
Tóm tắt - PCR đồng thuận và PCR Pan
PCR, được giới thiệu bởi Mulli, đóng một vai trò quan trọng mang tính cách mạng trong các ứng dụng sinh học phân tử. Đồng thuận và Pan PCR là hai loại PCR dựa trên vùng mục tiêu mồi của chúng. Trong khi PCR đồng thuận nhắm mục tiêu vào các vùng được bảo tồn, Pan PCR nhắm vào các vùng có thể thay đổi và đóng một vai trò quan trọng trong việc xác định chủng. Do sự khác biệt cơ bản này giữa PCR đồng thuận và PCR Pan, các chức năng cụ thể của từng loại PCR cũng khác nhau, từ phân tích phát sinh loài để xác định đặc điểm phân tử đến chẩn đoán phân tử.
