Sự khác biệt chính giữa ITS1 và ITS2 là ITS1 là DNA đệm nằm giữa các gen rRNA 18S và 5.8S ở sinh vật nhân chuẩn, trong khi ITS2 là DNA đệm nằm giữa các gen rRNA 5,8S và 28S ở sinh vật nhân chuẩn.
Bộ đệm phiên mã trong (ITS) là DNA đệm thường nằm giữa RNA ribosome tiểu đơn vị nhỏ và các gen RNA ribosome tiểu đơn vị lớn trong nhiễm sắc thể hoặc trong vùng phiên mã tương ứng trong phân tử phiên mã tiền thân polycistronic rRNA. Ở vi khuẩn và vi khuẩn cổ, chỉ có một ITS duy nhất giữa các gen rRNA 16S và 23S. Nhưng ở sinh vật nhân chuẩn, có hai DNA đệm ITS: ITS1 (giữa 18S và 5. Gen 8S rRNA) và ITS2 (giữa 5,8S và 28S rRNA). Do đó, ITS1 và ITS2 là hai DNA đệm được tìm thấy giữa các gen rRNA ở sinh vật nhân chuẩn.
ITS1 là gì?
ITS1 là một DNA đệm nằm giữa các gen rRNA 18S và 5,8S ở sinh vật nhân chuẩn. ITS đề cập đến một đoạn DNA đệm không có chức năng nằm giữa các gen rRNA. ITS1 có độ dài thay đổi lớn hơn ITS2. Độ dài biến thiên của ITS1 là khoảng (200-300bp). Các marker ITS như ITS1 đã chứng minh hiệu quả của chúng trong việc làm sáng tỏ mối quan hệ phát sinh loài giữa các đơn vị phân loại khác nhau. Hơn nữa, DNA đệm ITS1 ít được bảo tồn hơn DNA đệm ITS2. Các cấu trúc ITS1 chỉ được bảo tồn trong các đơn vị phân loại nhỏ hơn nhiều. Mỗi cụm ribosome của sinh vật nhân chuẩn cũng chứa các vùng được gọi là vùng đệm được phiên mã bên ngoài (5’và 3’ ETS).
Hình 01: Vùng ITS1
DNA của bộ đệm ITS1 rất gần với bộ đệm phiên mã 5’external (5’ETS). Hơn nữa, nếu bất kỳ ai muốn khuếch đại vùng ITS1 để nghiên cứu mối quan hệ phát sinh loài, họ phải sử dụng một cặp mồi cụ thể (cặp mồi ngược và mồi thuận) cho mục đích này. Để khuếch đại vùng ITS1, hai bộ mồi thường được sử dụng trong các giao thức PCR của các phòng thí nghiệm. Đó là ITS1 tiến và ITS2 ngược hoặc ITS1 tiến và ITS4 ngược.
ITS2 là gì?
ITS2 là một DNA đệm nằm giữa các gen rRNA 5,8S và 28S ở sinh vật nhân chuẩn. Vùng ITS2 có độ dài thay đổi ngắn hơn vùng ITS1. Độ dài biến thiên của ITS2 là khoảng (180-240bp). Tuy nhiên, vùng ITS2 được bảo tồn nhiều hơn vùng ITS1 ở nhiều đơn vị phân loại. Nó xác định rằng tất cả các trình tự ITS2 đều có chung một lõi của cấu trúc thứ cấp. Hơn nữa, 40% vùng ITS2 được bảo tồn trong số tất cả các thực vật hạt kín, trong khi có thể sắp xếp 50% vùng ITS2 giữa họ và cấp cao hơn.
Hình 02: Vùng ITS2
Bất kể phạm vi bảo tồn, việc sử dụng vùng ITS2 cũng rất phổ biến như vùng ITS1 trong các nghiên cứu mối quan hệ phát sinh loài, đặc biệt là trong mã vạch DNA của nấm. Để khuếch đại vùng ITS2, một bộ mồi cụ thể thường được sử dụng trong các giao thức PCR của các phòng thí nghiệm. Đó là ITS1 thuận và ITS4 ngược. Nhưng khi giao thức PCR sử dụng bộ mồi này, nó cũng khuếch đại vùng ITS1 cùng với vùng ITS2. Hơn nữa, DNA của bộ đệm ITS2 rất gần với bộ đệm phiên mã 3’external (3’ETS).
Điểm giống nhau giữa ITS1 và ITS2
- ITS1 và ITS2 là hai DNA đệm nằm giữa các gen rRNA.
- Chúng chỉ có ở sinh vật nhân chuẩn.
- Cả hai đều có thể được khuếch đại bằng cách sử dụng các cặp mồi cụ thể.
- Cả hai đều bị loại bỏ trong quá trình trưởng thành rRNA như là các sản phẩm phụ không có chức năng.
- Cả hai đều rất quan trọng đối với các nghiên cứu về mối quan hệ phát sinh loài, đặc biệt là trong mã vạch DNA của nấm.
Sự khác biệt giữa ITS1 và ITS2
ITS1 là DNA đệm nằm giữa các gen rRNA 18S và 5.8S ở sinh vật nhân chuẩn trong khi ITS2 là DNA đệm nằm giữa các gen rRNA 5,8S và 28S ở sinh vật nhân chuẩn. Vì vậy, đây là sự khác biệt chính giữa ITS1 và ITS2. Hơn nữa, ITS1 có độ dài thay đổi lớn hơn so với ITS2. Mặt khác, ITS2 có sự thay đổi chiều dài ngắn hơn so với ITS1. Đây là một điểm khác biệt giữa ITS1 và ITS2.
Đồ họa thông tin dưới đây liệt kê sự khác biệt giữa ITS1 và ITS2 ở dạng bảng để so sánh song song.
Tóm tắt - ITS1 vs ITS2
Vùng phiên mã bên trong (ITS) là một đoạn DNA đệm không có chức năng nằm giữa các gen rRNA. Ở vi khuẩn và vi khuẩn cổ, chỉ có một vùng ITS duy nhất. Nhưng ở sinh vật nhân thực, có hai vùng ITS: ITS1 và ITS2. ITS1 là DNA đệm nằm giữa các gen rRNA 18S và 5.8S ở sinh vật nhân chuẩn, trong khi ITS2 là DNA đệm nằm giữa các gen rRNA 5,8S và 28S ở sinh vật nhân chuẩn. Vì vậy, đây là tóm tắt về sự khác biệt giữa ITS1 và ITS2.
