Sự khác biệt chính giữa điện di trên gel agarose và polyacrylamide là điện di trên gel agarose sử dụng gel agarose được đổ theo chiều ngang để tách các đoạn DNA tương đối lớn hơn, trong khi điện di trên gel polyacrylamide sử dụng gel polyacrylamide được đổ theo chiều dọc để tách các đoạn axit nucleic ngắn hơn.
Điện di là một loại kỹ thuật sử dụng điện trường được áp dụng trên nền gel để tách các phân tử sinh học như DNA, RNA và protein. Sự phân tách các phân tử sinh học như DNA, RNA và protein thông qua điện di dựa trên điện tích và kích thước. Mẫu được nạp vào các giếng của gel. Sau đó, điện trường được áp dụng trên gel. Trường làm cho các phân tử mang điện tích âm chuyển động về phía điện cực dương. Chất nền gel hoạt động như một cái rây phân tử mà qua đó các phân tử nhỏ nhất đi qua hoặc di chuyển nhanh chóng trong khi các phân tử lớn hơn di chuyển chậm. Điều này cho phép phân tách các phân tử dựa trên điện tích và kích thước. Do đó, điện di trên gel agarose và polyacrylamide là hai loại kỹ thuật điện di trên gel chủ yếu giúp phân tách các phân tử dựa trên kích thước và điện tích của chúng.
Điện di Gel Agarose là gì?
Điện di trên gel agarose là kỹ thuật sử dụng gel agarose để tách ra các phân tử sinh học như DNA và RNA. Đây là một kỹ thuật được sử dụng để phân tách các axit nucleic chủ yếu theo kích thước. Hợp chất chính được gọi là agarose được sử dụng trong kỹ thuật này là một polysaccharide. Nó đến từ rong biển. Agarose có thể được hòa tan trong dung dịch đệm sôi và sau đó có thể được đổ vào khay được giữ theo chiều ngang. Trong khay, nó trở nên đông đặc khi nguội đi để tạo thành một phiến. Gel agarose được đổ bằng một chiếc lược tại chỗ để tạo thành các giếng để các axit nucleic như DNA hoặc RNA được nạp vào sau khi gel đã đông đặc.
Hình 01: Điện di Gel Agarose
Gel sau đó được nhúng vào một chất đệm thích hợp, và một dòng điện được áp dụng trên gel. DNA có điện tích âm thống nhất mà không phụ thuộc vào thành phần trình tự của phân tử. Do đó, các phân tử DNA sẽ di chuyển từ cực âm (-) về phía cực dương (+). Tốc độ di chuyển phụ thuộc trực tiếp vào kích thước của phân tử. Các đại phân tử lớn nhất có thời gian khó di chuyển qua gel nhất. Mặt khác, các đại phân tử nhỏ hơn trượt qua gel nhanh chóng và khá dễ dàng.
Điện di Polyacrylamide Gel là gì?
Điện di trên gel polyacrylamide (TRANG) là một kỹ thuật sử dụng gel polyacrylamide để tách ra các phân tử sinh học. Đây là một kỹ thuật được sử dụng rộng rãi để tách các đại phân tử sinh học, thường là protein và axit nucleic, theo tính di động điện di của chúng. Quá trình hydrat hóa acrylonitrile dẫn đến sự hình thành các phân tử acrylamide bởi nitrile hydratase. Acrylamide hòa tan trong nước, và khi bổ sung các chất khởi tạo gốc tự do, acrylamide polyme hóa, dẫn đến sự hình thành gel polyacrylamide. Thông thường, nồng độ acrylamide tăng lên dẫn đến giảm kích thước lỗ chân lông trong gel. Gel polyacrylamide được đổ theo chiều dọc, không giống như gel agarose.
Hình 02: Điện di trên Gel Polyacrylamide
Trong điện di trên gel polyacrylamide, các phân tử có thể chạy ở trạng thái ban đầu của chúng, bảo toàn cấu trúc bậc cao của phân tử. Phương thức này được gọi là PAGE gốc. Ngoài ra, một chất biến tính hóa học cũng có thể được thêm vào để loại bỏ cấu trúc bậc cao hơn và biến phân tử thành một phân tử không có cấu trúc mà độ linh động của nó chỉ phụ thuộc vào chiều dài của nó. Loại này được gọi là SDS-PAGE.
Điểm Giống nhau giữa Điện di Gel Agarose và Polyacrylamide là gì?
- Điện di gel agarose và polyacrylamide là hai loại kỹ thuật điện di trên gel.
- Trên thực tế, chúng là các kỹ thuật sinh học phân tử.
- Cả hai kỹ thuật đều được sử dụng để phát hiện các đại phân tử sinh học như DNA và protein.
- Những kỹ thuật này được thực hiện bởi các kỹ thuật viên hoặc nhà nghiên cứu lành nghề.
- Trong cả hai kỹ thuật, sự phân tách của các đại phân tử dựa trên điện tích và kích thước.
- Cả hai kỹ thuật đều cho phép tách các axit nucleic như DNA và RNA.
Sự Khác Biệt Giữa Điện Di Gel Agarose và Polyacrylamide là gì?
Điện di gel agarose là kỹ thuật sử dụng gel agarose đổ theo chiều ngang để tách các phân tử sinh học ra, trong khi điện di trên gel polyacrylamide là kỹ thuật sử dụng gel polyacrylamide được đổ theo chiều dọc để tách các phân tử sinh học. Đây là điểm khác biệt chính giữa điện di trên gel agarose và polyacrylamide. Hơn nữa, điện di trên gel agarose được sử dụng để tách DNA và RNA, trong khi điện di trên gel polyacrylamide được sử dụng để tách các axit nucleic như DNA, RNA hoặc protein.
Bảng sau đây tóm tắt sự khác biệt giữa điện di trên gel agarose và polyacrylamide.
Tóm tắt - Điện di Gel Agarose vs Polyacrylamide
Điện di trên gelagarose và polyacrylamide là hai loại kỹ thuật điện di trên gel được sử dụng trong các phòng thí nghiệm sinh học phân tử. Điện di trên gel agarose sử dụng gel agarose để tách các phân tử sinh học. Agarose nói chung không độc đối với con người, trong khi polyacrylamide độc với người. Hơn nữa, điện di trên gel agarose cho thấy độ phân giải thấp trong khi điện di trên gel polyacrylamide cho thấy độ phân giải cao hơn. Điện di trên gel polyacrylamide sử dụng gel polyacrylamide để tách ra các phân tử sinh học. Phần này tóm tắt sự khác biệt giữa điện di trên gel agarose và polyacrylamide