Sự khác biệt chính - Exome vs Transcriptome
Một gen chứa các vùng mã hóa và không mã hóa bên trong nó. Trình tự mã hóa được gọi là exon, và trình tự không mã hóa được gọi là intron. Trình tự nucleotit của các exon của gen đại diện cho mã di truyền của gen đó để tổng hợp protein cụ thể. Do đó, các exon vẫn còn trong phân tử mRNA. Tổng số vùng exon của bộ gen được gọi là exome, và nó là một phần quan trọng của bộ gen. Mã di truyền của các gen được chuyển thành mã di truyền của phân tử mRNA, mã này cần thiết cho việc sản xuất protein. Toàn bộ phân tử mRNA được phiên mã trong một tế bào hoặc một quần thể tế bào tại một thời điểm được gọi là một bộ phiên mã. Sự khác biệt chính giữa exome và transcriptome là exome đại diện cho trình tự của các vùng exon của bộ gen trong khi transcriptome đại diện cho tổng mRNA của tế bào hoặc mô tại một thời điểm nhất định.
Exome là gì?
Gen bao gồm exon, intron và trình tự điều hòa. Exon là vùng gen được phiên mã thành trình tự mRNA trong quá trình phiên mã. Intron và các vùng không mã hóa khác bị loại bỏ trong quá trình phiên mã. Trình tự nucleotide của exon xác định mã di truyền của gen tổng hợp protein cụ thể mà nó mã hóa. Chỉ các exon còn lại trong mRNA của protein. Tập hợp các exon trong bộ gen được gọi là exome của một sinh vật. Nó đại diện cho một phần của bộ gen được biểu hiện trong các gen. Ở người, exome chiếm 1% từ bộ gen. Nó là phần mã hóa protein của bộ gen người.
Hình 01: Exome
Transcriptome là gì?
Bộ phiên mã là tập hợp tất cả các phiên mã mã hóa protein và không mã hóa (RNA) trong một mô nhất định. Transcriptome đại diện cho tập hợp tổng số phân tử mRNA được biểu hiện bởi các gen trong tế bào hoặc mô. Bộ phiên mã của một tế bào có thể thay đổi với bộ phiên mã của một loại tế bào khác. Hệ thống phiên mã cũng rất năng động - nó thay đổi theo thời gian để phản ứng với các kích thích bên trong và bên ngoài. Ngay cả trong cùng một mô hoặc trong cùng một loại tế bào, bản sao có thể thay đổi sau vài phút.
Bản sao khác với exome của sinh vật. Transcriptome chỉ bao gồm các trình tự exome được biểu hiện. Mặc dù exome của một tế bào vẫn giống nhau, nhưng transcriptome khác nhau giữa các tế bào vì sự biểu hiện gen không giống nhau đối với tất cả các tế bào hoặc mô. Chỉ các gen thiết yếu mới được biểu hiện trong các tế bào và mô khác nhau. Biểu hiện gen là một quá trình cụ thể của mô hoặc loại tế bào. Nó được điều chỉnh bởi các yếu tố khác nhau bao gồm cả các yếu tố môi trường. Do đó, transcriptome có thể thay đổi theo điều kiện môi trường bên ngoài.
Transcriptome được sử dụng làm tiền thân cho các nghiên cứu về protein. Tất cả các protein đều có nguồn gốc từ trình tự mRNA. Các sửa đổi dịch mã có thể dẫn đến những thay đổi trong protein. Tuy nhiên, transcriptome cung cấp thông tin cơ bản quan trọng cho các nghiên cứu về protein.
Hình 02: Phiên mã của tế bào gốc phôi
Sự khác biệt giữa Exome và Transcriptome là gì?
Exome vs Transcriptome |
|
| Exome là tập hợp các vùng mã hóa protein của các gen. | Bộ phiên mã là tập hợp tất cả RNA đã phiên mã bao gồm mRNA. |
| Mẫu | |
| Exome được nghiên cứu bằng cách sử dụng mẫu DNA. | Phiên mã được nghiên cứu bằng cách sử dụng mẫu RNA. |
| Phương pháp học | |
| Giải trình tự toàn bộ exome là phương pháp nghiên cứu exome. | Giải trình tự RNA là phương pháp nghiên cứu phiên mã. |
Tóm tắt - Exome vs Transcriptome
Exons là trình tự mã hóa của gen và xác định trình tự mRNA của protein. Tập hợp các trình tự mã hóa này (exon) được gọi là exome của một sinh vật. Các gen được phiên mã thành các phân tử mRNA trước khi tạo ra các protein. Tổng số phân tử mRNA của tế bào hoặc mô tại bất kỳ thời điểm nào được gọi là transcriptome. Transcriptome đại diện cho các gen đang được biểu hiện tích cực thành mRNA tại bất kỳ thời điểm nào. Transcriptome là tế bào và mô cụ thể và ảnh hưởng đến các điều kiện môi trường. Đây là sự khác biệt giữa exome và transcriptome.
