Sự khác biệt chính giữa FISH và CGH là FISH là một kỹ thuật phân tử phát hiện trình tự DNA cụ thể trên nhiễm sắc thể bằng cách sử dụng các đầu dò được đánh dấu huỳnh quang, trong khi CGH là một kỹ thuật di truyền tế bào phân tử khác phát hiện những thay đổi trong DNA bộ gen.
Phân tích di truyền tế bào đóng vai trò quan trọng trong y học khi phát hiện các bất thường về nhiễm sắc thể như dị bội, mất đoạn, nhân đôi, sắp xếp lại, … Bất thường nhiễm sắc thể cuối cùng dẫn đến các bệnh di truyền như ung thư, vô sinh, hội chứng Down, hội chứng Klinefelter, Turner hội chứng, bệnh bạch cầu, vv Có nhiều phương pháp di truyền tế bào phân tử khác nhau để phát hiện các khuyết tật và bệnh nói trên. Trong số đó, FISH (lai huỳnh quang tại chỗ) và CGH (lai bộ gen so sánh) là hai kỹ thuật lai mạnh mẽ. Tuy nhiên, cả hai phương pháp đều có ưu và nhược điểm.
CÁ là gì?
FISH là một kỹ thuật lai axit nucleic được thực hiện trên một phần hoặc một phần của mô, trong toàn bộ mô hoặc tế bào. Nó là một phương pháp dựa trên thăm dò. Kỹ thuật này phụ thuộc vào lý thuyết về sự kết cặp cơ sở bổ sung của Watson Crick, tạo ra các phép lai DNA - DNA hoặc DNA - RNA, do đó có thể phát hiện các gen bị đột biến hoặc có thể xác định được gen quan tâm. Hơn nữa, kỹ thuật này sử dụng trình tự DNA sợi đơn, trình tự DNA sợi đôi, trình tự RNA sợi đơn hoặc oligonucleotide tổng hợp được chuẩn bị bằng cách sử dụng dịch mã làm đầu dò bổ sung cho trình tự gen quan tâm. Bên cạnh đó, tính năng quan trọng nhất của kỹ thuật này là ghi nhãn các đầu dò bằng thuốc nhuộm huỳnh quang. Do đó, các đầu dò liên kết với các phần bổ sung của nhiễm sắc thể và giúp dễ dàng phát hiện.
Hơn nữa, FISH là một phương pháp có độ nhạy và đặc hiệu cao. Do đó, đây là một kỹ thuật phổ biến trong cả nghiên cứu và chẩn đoán các khối u ác tính huyết học và các khối u đặc. Nhưng, FISH cho thấy độ phân giải thấp. Nó cũng yêu cầu kiến thức trước về sự bất thường của mục tiêu để thiết kế trình tự thăm dò.
Hình 01: CÁ
Có rất nhiều ứng dụng của FISH, chủ yếu trong chẩn đoán phân tử các bệnh truyền nhiễm để xác định sự hiện diện của mầm bệnh và xác nhận mầm bệnh thông qua chẩn đoán phân tử. Hơn nữa, FISH là một kỹ thuật được sử dụng phổ biến trong các lĩnh vực sinh học phát triển, phân tích karyotyping và phát sinh loài và lập bản đồ vật lý của nhiễm sắc thể.
CGH là gì?
Lai ghép bộ gen so sánh (CGH) là một kỹ thuật di truyền tế bào phân tử dựa trên DNA khác có thể phát hiện những thay đổi của trình tự DNA bộ gen. Phương pháp này là một phương pháp tiên tiến có thể phân tích các biến đổi về nhiễm sắc thể và gen để phát hiện những thay đổi hoặc biến đổi trong trình tự DNA bộ gen. Hơn nữa, CGH yêu cầu phân lập và phân mảnh DNA từ mẫu thử nghiệm và mẫu đối chứng. Sau đó, các mẫu phải được dán nhãn bằng cách sử dụng hai loại thuốc nhuộm huỳnh quang khác nhau (thường là đỏ và xanh lá cây). Sau đó, cả hai mẫu được trộn và cho phép lai cạnh tranh. Bước cuối cùng là phân tích mẫu để tìm những thay đổi trong DNA như sao chép gen, mất gen, … Đặc biệt, nó đo lường sự khác biệt về số lượng bản sao DNA giữa mẫu thử nghiệm và mẫu đối chứng.
Hình 02: CGH
Phiên bản khác của CGH hiện có sẵn; nó là một phương pháp tiên tiến hơn so với CGH bình thường. Nó là một kỹ thuật được gọi là CGH dựa trên mảng hoặc aCGH. aCGH cho phép xác định chính xác sự mất đoạn gen hoặc trình tự trong nhiều nghìn trình tự trong một thí nghiệm duy nhất.
Điểm giống nhau giữa FISH và CGH là gì?
- FISH và CGH là hai kỹ thuật phân tử.
- Cả FISH và CGH đều dựa vào sự lai tạo axit nucleic.
- Ngoài ra, cả hai kỹ thuật đều cần các đầu dò được thiết kế để phát hiện các mục tiêu DNA cụ thể.
- Chúng tôi sử dụng chúng để chẩn đoán các bệnh di truyền trước khi sinh và sau sinh.
- Hơn nữa, cả FISH và CGH đều là những công cụ rất mạnh để nghiên cứu sự thay đổi bộ gen.
- Họ sử dụng thuốc nhuộm huỳnh quang để dán nhãn cho các đầu dò.
Sự khác biệt giữa FISH và CGH là gì?
FISH là một quy trình lai tại chỗ sử dụng đầu dò huỳnh quang để phát hiện các trình tự DNA cụ thể, trong khi CGH là một kỹ thuật lai phân tử để phát hiện các thay đổi của trình tự DNA bộ gen. Vì vậy, đây là điểm khác biệt chính giữa FISH và CGH.
Hơn nữa, FISH yêu cầu kiến thức trước về sự bất thường của mục tiêu để thiết kế trình tự thăm dò, trong khi CGH không yêu cầu kiến thức trước. Ngoài ra, một điểm khác biệt nữa giữa FISH và CGH là FISH hiển thị độ phân giải hạn chế trong khi aCGH hiển thị độ phân giải cao.
Infographic dưới đây tóm tắt sự khác biệt giữa FISH và CGH.
Tổng hợp - CÁ vs CGH
FISH và CGH là hai kỹ thuật di truyền tế bào phân tử tạo điều kiện thuận lợi cho việc phát hiện các trình tự gen được quan tâm. FISH tạo điều kiện thuận lợi cho việc phát hiện trình tự DNA cụ thể trên nhiễm sắc thể bằng cách sử dụng các đầu dò được đánh dấu huỳnh quang trong khi CGH tạo điều kiện phát hiện các thay đổi trong DNA bộ gen. Vì vậy, đây là điểm khác biệt chính giữa FISH và CGH.
