Sự khác biệt chính giữa CGH và mảng CGH là CGH là một phương pháp di truyền tế bào phân tử truyền thống để phân tích sự biến đổi số lượng bản sao trong DNA của mẫu thử nghiệm có độ phân giải thấp hơn, trong khi mảng CGH là một phương pháp di truyền tế bào phân tử hoàn toàn tự động cho phân tích sự biến đổi số bản sao trong DNA của mẫu thử nghiệm có độ phân giải cao hơn.
CGH và mảng CGH là hai kỹ thuật để phát hiện các biến thể số bản sao ở các cá thể. Sự thay đổi số lượng bản sao đề cập đến các phần của bộ gen được lặp lại. Số bản sao khác nhau giữa các cá nhân. Biến thể số sao chép thường được phân loại thành hai nhóm: số lần lặp lại ngắn và số lần lặp lại dài. Một trong những ví dụ nổi tiếng nhất về sự biến đổi số lượng bản sao ngắn là sự lặp lại của trinucleotide CAG trong gen Huntingtin. Điều này gây ra một chứng rối loạn thần kinh được gọi là Huntingtin. Ví dụ tốt nhất cho sự biến đổi số lượng bản sao lặp đi lặp lại dài là gen alpha amylase, gây ra kháng insulin. Biến thể số bản sao có thể được phát hiện bằng các kỹ thuật như FISH, CGH và mảng CGH.
CGH là gì?
CGH là một phương pháp di truyền tế bào phân tử truyền thống để phân tích sự thay đổi số lượng bản sao trong DNA của một mẫu thử nghiệm so với một mẫu tham chiếu. Nó có độ phân giải thấp hơn so với các kỹ thuật tự động. Mục tiêu của kỹ thuật này là so sánh nhanh chóng và hiệu quả hai mẫu DNA bộ gen phát sinh từ các nguồn khác nhau.
Hình 01: CGH
Quy trình liên quan đến việc phân lập DNA từ hai nguồn: thử nghiệm và tham chiếu. Sau đó, bước tiếp theo là ghi nhãn độc lập cho các mẫu DNA thử nghiệm và tham chiếu với các fluorophores có màu sắc khác nhau. Sau đó, hai mẫu DNA được biến tính để có được các mẫu DNA sợi đơn. Cuối cùng, việc lai hai mẫu DNA thu được theo tỷ lệ 1: 1 với sự lây lan nhiễm sắc thể chuyển dạng bình thường đã được thực hiện. Sự khác biệt về nhiễm sắc thể có thể được xác định giữa hai nguồn bằng kính hiển vi huỳnh quang và phần mềm máy tính. Hơn nữa, kỹ thuật CGH chỉ có thể phát hiện các bất thường nhiễm sắc thể không cân bằng.
Mảng CGH là gì?
Array CGH là một phương pháp di truyền tế bào phân tử hoàn toàn tự động để phân tích sự thay đổi số lượng bản sao trong DNA của một mẫu thử nghiệm so với một mẫu tham chiếu. Nó có độ phân giải cao hơn, và nó được phát triển để giảm thiểu những hạn chế của CGH truyền thống. Mảng CGH kết hợp các nguyên tắc của CGH với việc sử dụng các vi mảng. Thay vì sử dụng sự lây lan nhiễm sắc thể siêu phân tử, phương pháp này sử dụng các trang trình bày được sắp xếp với các đoạn DNA nhỏ làm mục tiêu. Những vi mảng này được tạo ra bằng cách lắng đọng và cố định một lượng nhỏ DNA (mẫu dò) trên một giá đỡ bằng thủy tinh vững chắc. Kích thước của các đầu dò có thể thay đổi từ oligonucleotide đến nhiễm sắc thể nhân tạo của vi khuẩn.
Hình 02: Mảng CGH
Bất kể các đầu dò, phương thức cơ bản của mảng CGH tương tự như CGH. Khi các đầu dò có chứa microarray được chuẩn bị, hai mẫu DNA (thử nghiệm và đối chiếu) được đánh dấu bằng các fluorophores có màu sắc khác nhau sẽ được trộn với nhau và thêm vào microarray. Vì DNA trong các mẫu là chuỗi đơn do biến tính, nên DNA này sẽ lai với các đầu dò chuỗi đơn được sắp xếp theo mảng. Sử dụng hệ thống hình ảnh kỹ thuật số, có thể xác định sự khác biệt về nhiễm sắc thể giữa hai nguồn.
Điểm giống nhau giữa CGH và mảng CGH là gì?
- CGH và mảng CGH là hai kỹ thuật để phát hiện các biến thể của số bản sao.
- Chúng là các phương pháp di truyền tế bào phân tử.
- Cả hai phương pháp đều chẩn đoán các bất thường nhiễm sắc thể không cân bằng.
- Fluorophores liên quan đến cả hai phương pháp.
- Cả hai phương pháp đều có thể được sử dụng để phát hiện các rối loạn di truyền do các biến thể số lượng bản sao.
- Chúng được sử dụng rộng rãi trong phân tích bộ gen so sánh.
Sự khác biệt giữa CGH và Mảng CGH là gì?
CGH là một phương pháp di truyền tế bào phân tử truyền thống để phân tích sự thay đổi số lượng bản sao trong DNA của một mẫu thử nghiệm có độ phân giải thấp hơn, trong khi mảng CGH là một phương pháp di truyền tế bào phân tử hoàn toàn tự động để phân tích sự thay đổi số lượng bản sao trong DNA của một mẫu thử nghiệm có độ phân giải cao hơn. Vì vậy, đây là sự khác biệt chính giữa CGH và mảng CGH. Hơn nữa, trong CGH, các mẫu DNA thử nghiệm và tham chiếu lai với sự lây lan của nhiễm sắc thể chuyển dạng bình thường, nhưng trong mảng CGH, các mẫu DNA thử nghiệm và tham chiếu lai với các đầu dò DNA cố định có chứa microarray.
Đồ họa thông tin dưới đây liệt kê sự khác biệt giữa CGH và mảng CGH ở dạng bảng để so sánh song song.
Tóm tắt - CGH vs Mảng CGH
CGH và CGH mảng là hai kỹ thuật di truyền tế bào phân tử để phát hiện các bất thường nhiễm sắc thể không cân bằng. Chúng được sử dụng rộng rãi trong phân tích bộ gen so sánh. CGH là một phương pháp di truyền tế bào phân tử truyền thống để phân tích sự biến đổi số lượng bản sao trong DNA của mẫu thử nghiệm có độ phân giải thấp hơn. Ngược lại, mảng CGH là một phương pháp di truyền tế bào phân tử hoàn toàn tự động để phân tích sự biến đổi số lượng bản sao trong DNA của mẫu thử nghiệm có độ phân giải cao hơn. Do đó, điều này tóm tắt sự khác biệt giữa CGH và mảng CGH.
