Sự khác biệt chính giữa QTL và GWAS dựa vào loại trình tự được sử dụng trong phân tích. QTL sử dụng các locus gen liên kết để phân tích các đặc điểm kiểu hình liên quan đến di truyền đa gen trong khi GWAS sử dụng toàn bộ trình tự gen để phân tích các đa hình nucleotide đơn của một điều kiện cụ thể.
Bản đồ QTL và GWAS đóng một vai trò quan trọng trong phân tích di truyền cho các tính trạng khác nhau. Hơn nữa, chúng rất quan trọng trong việc phân tích các tình trạng bệnh khác nhau với nguyên nhân chưa biết. Ngoài ra, trình tự đóng một vai trò quan trọng trong cả hai kỹ thuật. Các kỹ thuật này có thể được kết hợp thêm với các kỹ thuật thông lượng cao khác để tăng độ chính xác và độ chính xác.
QTL là gì?
QTL là viết tắt của Định lượng Đặc điểm Định vị. Nó là một vùng của DNA liên kết với một tính trạng kiểu hình. Nói chung, một QTL làm phát sinh hiệu ứng đa gen. Sự phân bố của các QTL khác nhau, và số lượng QTL cho thấy mức độ biến đổi của một tính trạng kiểu hình cụ thể. Hơn nữa, chúng thường mã hóa cho các đặc điểm liên tục chứ không phải các đặc điểm rời rạc.
Khi xác định các vùng QTL, điều quan trọng là phải sắp xếp một vùng QTL cụ thể. Hơn nữa, để dễ dàng điều tra và nghiên cứu, việc giải trình tự và lưu trữ dữ liệu trình tự của các vùng QTL chung diễn ra với sự tham gia của tin sinh học. Chúng tôi gọi kỹ thuật này là ánh xạ QTL. Sau đó, một cơ sở dữ liệu được xây dựng với trình tự vùng QTL.
Hình 01: Quét QTL
Hơn nữa, các ứng dụng của trình tự QTL chủ yếu dựa vào công cụ BLAST, nơi có thể xác định độ giống nhau về trình tự. Nó quan trọng trong việc suy luận mối quan hệ giữa các sinh vật. Hơn nữa, điều quan trọng là xác định độ phức tạp của một kiểu hình đa gen cụ thể. Nó cũng xác định sự phát triển của một đặc điểm cụ thể.
Hiện tại, phân tích QTL được kết hợp với các kỹ thuật thông lượng cao khác như vi mạch DNA. Điều này rất quan trọng trong việc phân tích biểu hiện của kiểu hình. Hiện nay, các nhà khoa học quan tâm nhiều đến việc phát triển cơ sở dữ liệu QTL vì các vùng QTL chịu trách nhiệm về nhiều đặc điểm quan trọng của các loài khác nhau.
GWAS là gì?
GWAS là viết tắt của Genome Wide Association Study. Nó cũng đề cập đến các nghiên cứu liên kết toàn bộ bộ gen. Các nghiên cứu này tập trung chủ yếu vào các nghiên cứu quan sát. Nó phân tích các biến thể di truyền của các cá thể khác nhau thường liên quan đến một đặc điểm cụ thể. Hơn nữa, toàn bộ bộ gen rất quan trọng đối với phân tích GWAS.
Hình 02: GWAS
GWAS là một công cụ quan trọng trong việc phân tích các đa hình nucleotide đơn liên quan đến các tình trạng bệnh khác nhau. Đây cũng là một nghiên cứu so sánh về các đa hình nucleotide đơn khác nhau trên một quần thể rộng. Ngoài ra, mẫu nghiên cứu của GWAS rất cao; do đó, nó cũng có định dạng là một nghiên cứu đoàn hệ cắt ngang.
Hơn nữa, nghiên cứu GWAS đầu tiên đã diễn ra liên quan đến nhồi máu cơ tim và phân tích các gen liên quan đến nhồi máu cơ tim. Hiện tại, GWAS đóng một vai trò quan trọng trong việc xác định nền tảng di truyền của các bệnh phức tạp không rõ nguyên nhân.
Điểm tương đồng giữa QTL và GWAS là gì?
- Họ dựa vào dữ liệu trình tự DNA để phân tích.
- Cả hai đều liên quan đến nguồn gốc di truyền của các nhân vật khác nhau.
- Hơn nữa, chúng yêu cầu các công cụ tin sinh học để suy luận và giải thích kết quả.
- Chúng được thực hiện trên quần thể lớn.
Sự khác biệt giữa QTL và GWAS là gì?
QTL phân tích các đặc điểm kiểu hình liên quan đến di truyền đa gen bằng cách sử dụng các locus gen liên kết trong khi GWAS phân tích các đa hình nucleotide đơn của một điều kiện cụ thể bằng cách sử dụng toàn bộ trình tự gen. Do đó, đây là sự khác biệt chính giữa QTL và GWAS. Lập bản đồ QTL tương đối là một kỹ thuật ít phức tạp hơn GWAS vì nó yêu cầu giải trình tự toàn bộ bộ gen.
Infographic dưới đây tóm tắt sự khác biệt giữa QTL và GWAS ở dạng bảng.
Tóm tắt - QTL vs GWAS
Lập bản đồ QTL và GWAS đóng một vai trò quan trọng trong việc xác định nền tảng di truyền của các tính trạng kiểu hình khác nhau. Họ cũng giúp phân tích nền tảng di truyền của các bệnh khác nhau. Bản đồ QTL lập bản đồ các gen liên kết chịu trách nhiệm cho các tính trạng liên tục và cũng liên quan đến việc lập bản đồ các gen di truyền đa gen. Mặt khác, GWAS diễn ra với việc phân tích toàn bộ bộ gen để tìm các đa hình nucleotide đơn. Ngoài ra, điều này diễn ra trên một quần thể lớn hơn. Vì vậy, đây là tóm tắt về sự khác biệt giữa QTL và GWAS.
