Sự khác biệt chính giữa cấu hình polysome và cấu hình ribosome là cấu hình polysome phân tích hành vi của ribosome bằng cách sử dụng cả ribosome và mRNA (polysome) trong quá trình dịch mã, trong khi cấu hình ribosome phân tích hành vi của ribosome chỉ sử dụng trình tự mRNA trong quá trình dịch mã.
Dịch mã là giai đoạn thứ hai của quá trình tổng hợp protein, chuyển đổi thông tin trong mRNA thành trình tự axit amin. Translatomics là một nghiên cứu về các ORF (khung đọc mở) được dịch tích cực trong tế bào của một sinh vật. Kỹ thuật định hình polysome và ribosome là hai loại kỹ thuật trong lĩnh vực sinh học phân tử để đánh giá và suy ra các thông số khác nhau trong bối cảnh phân tích thể mờ.
Hồ sơ Polysome là gì?
Cấu hình polysome là một kỹ thuật suy ra trạng thái dịch mã của một mRNA cụ thể bằng cách phân tích hoạt động của cả ribosome và mRNA (polysome). Nói cách khác, kỹ thuật này cung cấp dữ liệu và kết luận về sự liên kết của mRNA với ribosome. Polysome đề cập đến nhóm ribosome liên kết với mRNA có trong giai đoạn kéo dài của quá trình dịch mã.
Hình 01: Cấu hình Polysome
Cấu hình polysome yêu cầu ly giải tế bào, sau đó được ly tâm. Sau đó, mẫu ly tâm được tách ra dựa trên mật độ của chúng để đặc trưng cho các tiểu đơn vị nhỏ và lớn của ribosome và mRNA tương ứng tham gia vào quá trình hình thành polysome. Hơn nữa, quá trình này cũng liên quan đến việc đo mật độ quang học. Các chuyên gia được yêu cầu thực hiện cấu hình polysome.
Kỹ thuật tạo hồ sơ polysome là một công cụ quan trọng cho nhiều ứng dụng. Các nhà khoa học sử dụng kỹ thuật này để nghiên cứu mức độ dịch mã trong tế bào. Cụ thể hơn, nó là một công cụ cung cấp thông tin chính xác về việc nghiên cứu các protein riêng lẻ và các mRNA cụ thể của chúng. Trong bối cảnh nghiên cứu mức độ dịch mã của một mRNA cụ thể, kỹ thuật cấu hình polysome là rất quan trọng. Tại đây, trình tự 3’và 5’ của mRNA có thể được khảo sát với sự tham chiếu đến ảnh hưởng của chúng đối với số lượng mRNA được tạo ra và mức độ dịch mã.
Cấu hình Ribosome là gì?
Cấu hình ribosome là một kỹ thuật phân tích hành vi của ribosome đối với mRNA của nó trong quá trình dịch mã. Kỹ thuật này được tìm ra và phát triển bởi Joan Steitz và Marilyn Kozak. Sau đó, công nghệ này đã được phát triển thêm bởi hai nhà khoa học Nicholas và Jonathan, kết hợp với giải trình tự thế hệ tiếp theo, dẫn đến sự phát triển của các kỹ thuật liên quan khác nhau như phương pháp Dịch chuyển Ribosome Affinity Purification (TRAP).
Hình 02: Trình tự Ribosome
Quy trình cấu hình ribosome bao gồm việc cô lập mRNA, loại bỏ RNA không liên kết với ribosome và tách mRNA liên kết với ribosome. Theo quy trình này, phân lập mRNA được phiên mã ngược và quá trình tổng hợp cDNA diễn ra. Cuối cùng, dữ liệu trình tự có thể được căn chỉnh với cấu hình dịch mã để suy ra các đặc điểm của hành vi ribosome đối với mRNA.
Cấu hình ribosome giúp nhiều nhà nghiên cứu xác định và suy ra vị trí của các vị trí bắt đầu dịch mã, phần bổ sung của khung đọc mở đã dịch (ORF) trong tế bào hoặc mô, sự phân bố của ribosome trên mRNA và tỷ lệ dịch mã ribôxôm. Cấu hình ribosome còn được gọi là dấu chân ribosome hoặc Ribo Seq.
Điểm giống nhau giữa Cấu hình Polysome và Cấu hình Ribosome là gì?
- Cấu hình polysome và ribosome là kỹ thuật sinh học phân tử quan trọng trong nghiên cứu.
- Họ cung cấp thông tin về quá trình dịch thuật.
- Cả hai quy trình lập hồ sơ đều cung cấp dữ liệu thông qua phân tích dịch mờ.
- Cần có các chuyên gia chuyên nghiệp để thực hiện cả hai kỹ thuật để có kết quả chính xác.
- Các công cụ tin sinh học đóng một vai trò quan trọng trong cả hai kỹ thuật.
Sự khác biệt giữa Cấu hình Polysome và Cấu hình Ribosome là gì?
Cấu hình polysome phân tích hành vi của ribosome bằng cách sử dụng cả ribosome và mRNA (polysome) trong quá trình dịch mã, trong khi cấu hình ribosome phân tích hành vi của ribosome chỉ sử dụng trình tự mRNA trong quá trình dịch mã. Do đó, đây là điểm khác biệt chính giữa định dạng polysome và định dạng ribosome. Hơn nữa, việc lập hồ sơ polysome liên quan đến các kỹ thuật như ly tâm gradient mật độ và đo mật độ quang, trong khi việc lập hồ sơ ribosome liên quan đến kỹ thuật tách và giải trình tự mRNA. Ngoài ra, cấu hình ribosome chính xác hơn cấu hình polysome.
Đồ họa thông tin dưới đây trình bày sự khác biệt giữa cấu hình polysome và ribosome ở dạng bảng để so sánh song song.
Tóm tắt - Cấu hình Polysome và Cấu hình Ribosome
Dịch mã là giai đoạn thứ hai của quá trình tổng hợp protein bao gồm việc chuyển đổi thông tin trên trình tự mRNA thành trình tự axit amin. Quá trình này yêu cầu khuôn mẫu mRNA, ribosome, axit amin, tRNA và các yếu tố khác. Cấu hình polysome và ribosome là hai kỹ thuật phân tử. Cấu hình polysome phân tích hành vi của ribosome bằng cách sử dụng cả ribosome và mRNA (polysome) trong quá trình dịch mã, trong khi cấu hình ribosome phân tích hành vi của ribosome chỉ sử dụng trình tự mRNA trong quá trình dịch mã. Cấu hình polysome liên quan đến các kỹ thuật như ly tâm gradient mật độ và phép đo mật độ quang học. Cấu hình ribosome liên quan đến các kỹ thuật như tách chiết mRNA, tổng hợp cDNA và giải trình tự. Vì vậy, phần này tóm tắt sự khác biệt giữa cấu hình polysome và cấu hình ribosome.
