Sự khác biệt cơ bản giữa phân lập DNA bộ gen và phân lập DNA plasmid là sự phân lập DNA bộ gen nhắm mục tiêu chiết xuất DNA bộ gen trong khi phân lập DNA plasmid nhắm mục tiêu chiết xuất DNA plasmid của vi khuẩn.
Phân lập DNA là một quá trình hóa học được sử dụng để phân lập DNA từ các loài khác nhau hoặc từ các mẫu khác nhau. Phân lập DNA rất quan trọng trong các kỹ thuật sinh học phân tử xuôi dòng, chẳng hạn như điện di trên gel, phản ứng chuỗi polymerase và kỹ thuật giải trình tự DNA. Do đó, phân lập DNA là một quá trình hóa học cần thiết trong các nghiên cứu sinh học phân tử. Căn cứ vào mục đích nghiên cứu, đôi khi cần phân lập DNA bộ gen. Ngoài ra, một số nghiên cứu tập trung vào việc phân lập DNA plasmid từ vi khuẩn. Phân lập ADN bộ gen là quá trình phân lập ADN bộ gen từ một mẫu sinh vật nhân sơ hoặc sinh vật nhân thực. Các bước phân lập khác nhau tùy theo loại tế bào mà DNA đang phân lập. Phân lập DNA plasmid là quá trình phân lập DNA plasmid từ tế bào vi khuẩn. So với phân lập DNA bộ gen, quy trình tổng thể phức tạp trong phân lập DNA plasmid.
Phân lập DNA bộ gen là gì?
Phân lập DNA bộ gen là quá trình tách chiết toàn bộ DNA bộ gen của một sinh vật. Quá trình cụ thể này liên quan đến ba sự kiện chính. Đó là, ly giải tế bào hoặc ly giải nhân, phân hủy protein hoặc phân giải protein và kết tủa DNA bộ gen. Bước ly giải có thể khác nhau tùy theo loại tế bào. Ở sinh vật nhân sơ, vì có thành tế bào peptidoglycan nên bước đầu tiên phải là sự phá vỡ thành tế bào. Mặt khác, ở sinh vật nhân thực, bước ly giải bao gồm việc phá vỡ màng sinh chất và màng nhân để đưa DNA ra bên ngoài. Ngược lại, các bước đặc biệt là cần thiết để làm khô thành tế bào thực vật và nấm.
Hình 01: Phân lập DNA bộ gen
Do đó, khi bước ly giải hoàn tất, cuối cùng DNA sẽ đến phần nổi. Đồng thời, sự phân huỷ protein cũng diễn ra trong dung dịch do bổ sung thêm proteinase K. Bước tiếp theo là tách DNA bộ gen và các protein bị phân huỷ ra khỏi nhau. Do đó, các protein bị phân hủy tách ra ngoài bằng cách kết tủa cho phép DNA bộ gen vẫn còn trong phần nổi phía trên. Sau khi kết tủa các protein, DNA bộ gen có thể được kết tủa và tái lơ lửng trong một bộ đệm thích hợp cho đến khi nó yêu cầu cho thí nghiệm.
DNA bộ gen, là DNA mạch thẳng chứa tất cả thông tin di truyền của một sinh vật. Nói cách khác, bộ gen là vật chất di truyền của một cơ thể sống, chịu trách nhiệm cho tất cả các hoạt động cấu trúc và chức năng của tế bào. Nó bao gồm cả trình tự DNA mã hóa và không mã hóa. Khi phân lập DNA bộ gen, nó bao gồm toàn bộ bộ gen của sinh vật.
Phân lập DNA Plasmid là gì?
Phân lập DNA plasmid là một quá trình phân lập DNA đặc biệt và phức tạp hơn. Plasmid là DNA ngoài nhiễm sắc thể có trong hầu hết các tế bào vi khuẩn. Chúng là DNA hình tròn không hoạt động hỗ trợ vi khuẩn tồn tại trong điều kiện môi trường khắc nghiệt. DNA plasmid bao gồm các gen kháng đặc biệt cung cấp các lợi thế bổ sung cho vi khuẩn như kháng kháng sinh, đặc tính độc lực và đặc tính độc hại.
Hình 02: Phân lập DNA plasmid
Phân lập DNA plasmid cũng bao gồm ba quá trình chính; ly giải tế bào, phân giải protein và kết tủa DNA. Mặc dù cơ chế phân lập sinh hóa tương tự như cơ chế phân lập DNA bộ gen, nhưng quá trình này phức tạp hơn nhiều. Quá trình ly giải tế bào là quá trình quan trọng nhất trong quy trình này. Quan trọng nhất, DNA bộ gen và DNA plasmid không được trộn lẫn với nhau. Do đó, một quy trình ly giải nhẹ nhàng hơn nhiều sẽ kết hợp với quy trình phân lập DNA plasmid. Do đó, trong hầu hết các quy trình phân lập DNA plasmid đều sử dụng chất tẩy rửa; natri dodecyl sulfat để ly giải tế bào.
Điểm giống nhau giữa DNA bộ gen và sự phân lập DNA plasmid là gì?
- Phân lập DNA bộ gen và DNA Plasmid tập trung vào việc trích xuất DNA của một sinh vật.
- Ngoài ra, cả hai đều tuân theo cùng một quy trình tổng thể bao gồm ly giải tế bào, phân hủy protein và kết tủa DNA.
- Hơn nữa, DNA kết quả của cả hai quá trình đều quan trọng đối với các quá trình hạ nguồn.
- Hơn nữa, cả hai quy trình phân lập đều bao gồm các bước để tinh sạch và lưu trữ DNA trong các điều kiện lưu trữ quy định.
- Bên cạnh đó, proteinase K được sử dụng trong cả hai phương pháp để phân hủy protein.
Sự khác biệt giữa DNA bộ gen và sự phân lập DNA plasmid là gì?
Phân lập DNA bộ gen tập trung vào việc chiết xuất toàn bộ DNA bộ gen của sinh vật đích trong khi phân lập DNA plasmid chỉ tập trung vào việc phân lập DNA plasmid từ loài vi khuẩn cụ thể. Do đó, đây là điểm khác biệt cơ bản giữa DNA bộ gen và phân lập DNA plasmid. Hơn nữa, một sự khác biệt khác giữa DNA bộ gen và phân lập DNA plasmid là ở quy trình. Phân lập DNA bộ gen là một quy trình ít phức tạp hơn so với phân lập DNA plasmid. Do đó, khi phân lập DNA plasmid, cần phải thực hiện các biện pháp phòng ngừa để ngăn chặn sự trộn lẫn DNA của bộ gen và plasmid với nhau.
Infograohic dưới đây cung cấp thêm chi tiết về sự khác biệt giữa DNA bộ gen và phân lập DNA plasmid.
Tóm tắt - Phân lập DNA bộ gen và DNA Plasmid
Phân lậpDNA là một quy trình quan trọng trong kỹ thuật sinh học phân tử. Có hai loại DNA cụ thể là DNA bộ gen và DNA plasmid (DNA ngoài nhiễm sắc thể). Dựa trên yêu cầu, một số quy trình được thực hiện để phân lập DNA bộ gen trong khi một số quy trình chỉ tập trung vào việc phân lập DNA plasmid từ vi khuẩn. Do đó, các bước liên quan trong cả hai quy trình hơi khác nhau. Tuy nhiên, quá trình tổng thể là giống nhau ở cả hai cách phân lập. DNA cô lập của cả hai quy trình có công dụng to lớn trong các quy trình hạ nguồn như nhân bản, điện di trên gel và phản ứng chuỗi polymerase. Khi kết thúc quy trình phân lập DNA bộ gen, toàn bộ DNA bộ gen của sinh vật có thể được phân lập như sản phẩm cuối cùng trong khi ở cuối quy trình phân lập DNA plasmid, DNA plasmid của vi khuẩn tương ứng có thể được phân lập như sản phẩm cuối cùng. Do đó, đây là sự khác biệt giữa DNA bộ gen và sự phân lập DNA plasmid.
