Sự khác biệt chính giữa MLVA và MLST là MLVA sử dụng tính đa hình của các trình tự DNA lặp đi lặp lại song song để đặc trưng cho các loài vi sinh vật, trong khi MLST sử dụng tính đa hình của trình tự DNA của các đoạn bên trong của nhiều gen quản lý để đặc trưng cho các loài vi sinh vật.
Đánh máy vi sinh thường được sử dụng để xác định nguồn gốc và đường lây nhiễm. Nó xác nhận hoặc ngăn chặn sự bùng phát. Đánh máy vi sinh cũng theo dõi sự lây truyền chéo của các mầm bệnh liên quan đến chăm sóc sức khỏe và nhận ra các chủng độc lực. Hơn nữa, đánh giá vi sinh vật đánh giá hiệu quả của các biện pháp kiểm soát các loài vi sinh vật gây bệnh. MLVA và MLST là hai kỹ thuật sinh học phân tử được sử dụng trong đánh máy vi sinh.
MLVA là gì?
Phân tích VNTR nhiều locus (MLVA) là một phương pháp sinh học phân tử sử dụng tính đa hình của các chuỗi DNA lặp đi lặp lại song song để xác định đặc điểm của các loài vi sinh vật. Đây là một phương pháp được sử dụng để phân tích di truyền của các loài vi sinh vật cụ thể.
Trong bước đầu tiên của MLVA, mỗi vị trí VNTR được nhắm mục tiêu được khuếch đại bằng PCR với các mồi đặc hiệu theo vùng bên sườn. Sau đó, các mảnh thu được có kích thước được phân tách bằng phương pháp điện di trên thiết bị tuần tự mao quản. Việc xác định kiểu gen của mỗi locus và kết quả tổng hợp từ mỗi mẫu cho phép xác định đặc điểm của vi sinh vật mà loài của chúng đã được biết đến. Nó cũng cho phép xác định các phân loài thông qua việc nhập alen và so sánh với cơ sở dữ liệu MLVA.
Hình 01: MLVA
Phương pháp MLVA này được lựa chọn nhiều hơn so với phương pháp MLST. Hơn nữa, phương pháp MLVA không yêu cầu bước giải trình tự DNA. Do đó, có thể phân biệt các loài phụ gần hoặc các loài vô tính.
MLST là gì?
Nhập trình tự đa chuỗi (MLST) là một kỹ thuật sử dụng tính đa hình của trình tự DNA của các đoạn bên trong của nhiều gen giữ nhà để xác định đặc điểm của các loài vi sinh vật. MLST là một kỹ thuật trong phân tích di truyền để gõ nhiều locus.
Hình 02: MLST
Đây là một kiểu gõ trình tự được sử dụng như một kỹ thuật tham chiếu để phân biệt các chủng vi sinh vật khác nhau. Phương pháp này dựa trên giải trình tự các gen quản lý. Các gen vệ sinh thường mã hóa các protein thiết yếu của các tác nhân vi sinh vật như vi khuẩn. Các trình tự gen quản lý này có đặc điểm đặc biệt là thể hiện tính đa hình ổn định theo thời gian. Do đó, sự khác biệt về trình tự của các gen giữ nhà là đủ để phân biệt các chủng với nhau. Hơn nữa, sơ đồ MLST đầu tiên được phát triển là Neisseria meningitidis, tác nhân gây bệnh viêm màng não do não mô cầu và nhiễm trùng huyết. Kể từ khi được giới thiệu, MLST không chỉ được sử dụng đối với mầm bệnh ở người mà còn đối với mầm bệnh thực vật.
Điểm giống nhau giữa MLVA và MLST là gì?
- MLVA và MLST là hai kỹ thuật sinh học phân tử được sử dụng trong đánh máy vi sinh.
- Cả hai kỹ thuật đều có thể được sử dụng để phân tích phát sinh loài vi sinh vật.
- Cả hai kỹ thuật đều dựa trên tính đa hình di truyền.
- Chúng có thể được sử dụng để phát hiện các bệnh ở người do vi sinh vật gây bệnh.
- Cả hai kỹ thuật phải được thực hiện bởi các nhà sinh học phân tử có tay nghề cao.
Sự khác biệt giữa MLVA và MLST là gì?
MLVA là một kỹ thuật sử dụng tính đa hình của các chuỗi DNA lặp đi lặp lại song song để đặc trưng cho các loài vi sinh vật. Trong khi đó, MLST là một kỹ thuật sử dụng tính đa hình của trình tự DNA của các đoạn bên trong của nhiều gen giữ nhà để xác định đặc điểm của các loài vi sinh vật. Vì vậy, đây là sự khác biệt chính giữa MLVA và MLST. Hơn nữa, phương pháp MLVA được lựa chọn nhiều hơn so với phương pháp MLST.
Đồ họa thông tin dưới đây trình bày sự khác biệt giữa MLVA và MLST ở dạng bảng để so sánh song song.
Tổng hợp - MLVA vs MLST
MLVA và MLST là hai kỹ thuật sinh học phân tử được sử dụng trong đánh máy vi sinh vật. MLVA sử dụng tính đa hình của các trình tự DNA lặp đi lặp lại song song để đặc trưng cho các loài vi sinh vật, trong khi MLST sử dụng tính đa hình của trình tự DNA của các đoạn bên trong của nhiều gen quản lý để mô tả các loài vi sinh vật. Vì vậy, đây là điểm khác biệt chính giữa MLVA và MLST.
