Sự khác biệt chính giữa xylene cyanol và bromophenol blue là trong gel agarose 1%, xylen cyanol di chuyển chậm hơn, trong khi bromophenol blue di chuyển nhanh hơn.
Xylene cyanol và bromophenol blue là chất đánh dấu màu quan trọng có thể được sử dụng để theo dõi quá trình điện di trên gel agarose và điện di trên gel polyacrylamide.
Xylene Cyanol là gì?
Xylene cyanol là chất đánh dấu màu điện di hoặc thuốc nhuộm theo dõi. Nó rất hữu ích trong việc theo dõi quá trình điện di trên gel agarose và điện di trên gel polyacrylamide. Khi chất này được trộn với mẫu, nồng độ của chất này thường trở thành khoảng 0.005% đến 0,03%. Một số từ đồng nghĩa mà chúng ta có thể sử dụng cho xylene cyanol bao gồm Acid Blue 147, xylene cyanole, xylene cyanol FF, xylene cyanole FF, v.v.
Công thức hóa học của hợp chất này là C25H27N2NaO 6S2Khối lượng mol của xylene xyanol là 538,61 g / mol. Chất này có thể di chuyển với tốc độ khoảng 4 - 5 đoạn DNA cặp kilobase trong gel agarose 1%. Tuy nhiên, điều này phụ thuộc vào bộ đệm mà chúng tôi sử dụng. Thông thường, xylene cyanol trên gel polyacrylamide 6% có thể di chuyển với tốc độ khoảng 140 đoạn DNA cặp bazơ. Mặt khác, nó có thể di chuyển trong điện di trên gel polyacrylamide biến tính 20% với tốc độ 25 base oligonucleotide.
Số lượng người cho liên kết hydro của xylene cyanol là 2m và số lượng người nhận liên kết hydro là 8. Số lượng liên kết có thể quay của hợp chất này có thể được đưa ra là 7. Độ phức tạp của xylene cyanol có thể được mô tả là 1120 độ. Nó có số lượng tâm lập thể liên kết xác định là 1.
Bromophenol Blue là gì?
Bromophenol blue là một chất chỉ thị pH hữu ích, rất hữu ích như một chất đánh dấu màu điện di và thuốc nhuộm. Nó có tên hóa học 3’, 3”, 5’, 5” -tetrabromophenolsulfonphthalein, BPB. Công thức hóa học của hợp chất này là C19H10Br4O5S. Khối lượng mol của hợp chất này là 669,96 g / mol. Nó không mùi và mật độ của nó có thể được đưa ra là 2,2 g / mL. Điểm nóng chảy của nó là 273 độ C và điểm sôi của nó là 279 độ C. Chúng ta có thể điều chế nó bằng cách cho từ từ brom dư vào dung dịch phenolsulfonphthalein đun nóng trong axit axetic băng.
Bromophenol blue hữu ích như một chất chỉ thị axit-bazơ trong khoảng pH từ 3,0 đến 4,6. Nó có thể chuyển từ màu vàng ở pH 3,0 đến pH 4,6. Hơn nữa, nó là một phản ứng thuận nghịch. Về cấu trúc, màu xanh bromophenol tương tự như phenolphtalein.
Bên cạnh đó, chúng ta có thể sử dụng nó như một điểm đánh dấu màu để theo dõi quá trình điện di trên gel agarose và điện di trên gel polyacrylamide. Chất này có thể mang điện tích âm ở pH vừa phải, nơi nó có thể di chuyển cùng chiều với DNA hoặc protein trong gel. Tốc độ di chuyển có thể thay đổi tùy theo mật độ gel và thành phần đệm. Tuy nhiên, trong gel agarose 1% điển hình trong đệm TAE 1 lần hoặc đệm TBE, chất này di chuyển với tốc độ tương tự như một đoạn DNA gồm khoảng 300 cặp bazơ.
Sự khác biệt giữa Xylene Cyanol và Bromophenol Blue là gì?
Xylene cyanol và xanh bromophenol là những chất đánh dấu màu quan trọng. Sự khác biệt chính giữa xylene cyanol và bromophenol blue là trong gel agarose 1%, xylen cyanol di chuyển chậm hơn, trong khi bromophenol blue di chuyển nhanh hơn.
Dưới đây là tóm tắt về sự khác biệt giữa xylene cyanol và bromophenol blue ở dạng bảng để so sánh song song.
Tóm tắt - Xylene Cyanol vs Bromophenol Blue
Xylene cyanol và bromophenol blue là chất đánh dấu màu quan trọng được sử dụng để theo dõi quá trình điện di trên gel agarose và điện di trên gel polyacrylamide. Sự khác biệt chính giữa xylene cyanol và bromophenol blue là trong gel agarose 1%, xylen cyanol di chuyển chậm hơn trong khi bromophenol blue di chuyển nhanh hơn.
